Kozak序列和sd序列定义区别即定义
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/06/17 15:01:19
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SD序列(Shine-Dalgarno sequence):mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列.
SD序列:在细菌mRNA 起始密码子AUG上游10个碱基左右处,有一段富含嘌呤的碱基序列,能与细菌16SrRNA3’端识别,帮助从起始AUG处开始翻译.在原核生物中,核糖体中与mRNA结合位点位于16S rRNA 的3’端,mRNA中与核糖体16S rRNA结合的序列称为SD序列(SD sequence),它是1974年由J.Shine 和 L.Dalgarno发现的,故此而命名.SD序列是mRNA中5’端富含嘌呤的短核苷酸序列,一般位于mRNA的起始密码AUG的上游3至11个核苷酸处,并且同16S rRNA 3’端的序列互补.
所谓Kozak规则,即第一个ATG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律,若将第一个ATG中的碱基A,T,G分别标为1,2,3位,则Kozak规则可描述如下:
(1)第4位的偏好碱基为G;
(2)ATG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T;
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好碱基;
(4)除-3,-6和-9位,在整个侧翼序列区,C是偏好碱基.
Kozak规则是基于已知数据的统计结果,不见得必须全部满足,一般来说,满足前两项即可
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